| 妖怪 | 出現する場所 | 概要 |
|---|
| オロチ（元祖限定） | おおもり山 山頂 夜 | エンディング後
おつかい横丁 どっこい書店 サブクエスト「あばれ大蛇とエンマ様」を解決する
好物：なし |
| キュウビ（本家限定） | さくら第一小学校 屋上 夜 | エンディング後
さくら第一小学校 理科室 昼 サブクエスト「稲荷神社のおキツネさま」を解決する
好物：なし |
| 黄泉ゲンスイ | 妖魔界 大王の門 | エンディング後
おおもり山 神社の裏 サブクエスト「妖魔界 再び」を解決する
好物：野菜 |
| うみぼうず | ナギサキ 凪岬神社 明け方 | エンディング後
ナギサキ 駅の左「ナゾのたてふだ」に「ミチクサメ」を配置して「すんどめ駅」に行けるようにする
サブクエスト「大海原の守り神」を解決する
好物：なし |
| ヤミまろ | 桜町地下水道 | エンディング後
おつかい横丁 つまみぐい小道 サブクエスト「狙われた おにぎり侍」を解決する
そよ風ヒルズから入った桜町地下水道 サブクエスト「いきもの係のヒミツ基地」を解決して「ゴールドキー」を入手する
桜町地下水道の一方通行を全て解除して「ごまみそ隊」から「赤いカードキー」を入手する
さくら中央シティ 会社近くの「ナゾのたてふだ」に「まぼ老師」を配置してビジネスガーデンビル 4階から「青いカードキー」を入手する
好物：肉 |
| 鬼食い | ケマモト村 キウチ山 山頂 | エンディング後
現代のおもいで屋の場所でホースを入手後
ケマモト村 キウチ山 山頂 サブクエスト「ニャーダの試練 EP2」の途中
好物：肉 |
| マスターニャーダ | ケマモト村 キウチ山 山頂 | エンディング後
ケマモト村 キウチ山 山頂 サブクエスト「ニャーダの試練 EP3」の途中
好物：魚 |
| ミツマタノヅチ（元祖限定） | さくら第一小学校 夜 | ヨロズマート おつかい横丁店前 サブクエスト「やぶられた結界」を解決する
好物：なし |
| つられたろう丸（本家限定） | おおもり山 滝 | おおもり山 山頂 サブクエスト「金のこけし銀のこけし」を解決する
好物：なし |
| どんちゃん | おおもり神社 夏祭り | おおもり山 神社 サブクエスト「おおもり神社の神隠し」を解決する
好物：スナック |
| ウ魔 | えんえんトンネル | ケマモト村 えんえんトンネルに入る
左側の13番非常口から出る
好物：野菜 |
| 妖怪 | 出現する場所 | 概要 |
|---|
| ロボガッパ | あおば駅 左端 | ダ「妖怪ウォッチ」単行本 第4巻を購入する
好物：すし |
| ロボニャンF型（元祖限定） | さくら第一小学校 2階 理科室 | ダウンロード版 妖怪ウォッチ2 元祖を購入する
特典の受け取り方はこちら<
好物：チョコボー |
| セーラーニャン（本家限定） | さくら第一小学校 2階 音楽室 | ダウンロード版 妖怪ウォッチ2 本家を購入する
特典の受け取り方はこちら<
好物：チョコボー |
| ワンダーニャン | ケマモト村 かわせみ渓谷 | ワンダーフリックをプレイしてLv.22まで上げると2014年7月9日のメンテナンス終了後からダウンロード番号が入手できる
詳しい入手方法はこちら
好物：チョコボー |
| フユニャン | 60年前のケマモト村 ヒミツ基地 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード
好物：魚 |
| ロボコマ | ひばり台駅 ホーム | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード
好物：牛乳 |
| ロボG | ひばり台駅 ホーム | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード
好物：おにぎり |
| キウイニャン | ケマモト村 分校 | まるごとともだちファンブック3を購入する
好物：チョコボー |
| ブドウニャン | ケマモト村 分校 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード：チョコボー |
| ミカンニャン | ケマモト村 分校 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード：チョコボー |
| スイカニャン | ケマモト村 分校 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード：チョコボー |
| イチゴニャン | ケマモト村 分校 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード：チョコボー |
| メロンニャン | ケマモト村 分校 | 妖怪メダル零 Zメダル キャンペーンメダルのQRコード：チョコボー |
